Master Biologie-Santé de Université Paris-Saclay
Le M2 international GenE2 s'adresse aux étudiants en Biologie, en Médecine, en Pharmacie, ou tout autre cursus scientifique adéquat, qui souhaitent acquérir des compétences dans la manipulation, le traitement et l'analyse statistique des données de séquençage haut-débit.
Cette formation est adaptée aux étudiants intéressés par les concepts et les technologies de la génétique, de la génomique, de l'épigénétique et de l'épigénomique en intégrant les aspects structuraux, fonctionnels et évolutifs.
Une originalité de ce parcours est d’intégrer les technologies récemment développées en les associant à une solide formation aux traitements et aux analyses des données haut-débit notamment via deux ateliers pratiques : ChIP-seq et Big Data.
Les points forts et l'originalité du Master 2 GenE2:
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Une formation double compétence : Biologie et Analyse des données
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Un atelier "ChIP-seq" : réalisation de A à Z d'une expérience d'immunoprécipitation de chromatine suivie d'un séquençage Illumina
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Un atelier "Big Data" : atelier pratique d'analyse des données de séquençage dont l’objectif est de familiariser les étudiants avec la manipulation et l’exploitation de données haut-débit issues de la génomique, l'épigénomique, la transcriptomique, ...
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Des unités d'enseignement sour forme de conférences en anglais données par des spécialistes de chaque domaine
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Un stage de 6 mois dans une équipe de recherche ou en entreprise
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Un réseau de laboratoires d'accueil en Ile-de-France, en France et à l'étranger
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Les objectifs pédagogiques
Les objectifs pédagogiques de GenE2 vise à former les étudiants aux concepts et aux technologies de la génétique, de la génomique, de l'épigénétique et de l'épigénomique en intégrant les aspects structuraux, fonctionnels et évolutifs.
Au delà de la description des mécanismes, il s’agit également de comprendre les processus qui ont pu conduire à leur émergence et à leur évolution.
Une originalité de ce parcours est d’intégrer les technologies récemment développées en les associant à une solide formation aux traitements et aux analyses des données haut-débit notamment via deux ateliers pratiques : ChIp-seq et BigData.
La formation pour et par la recherche de ce parcours inclut l’étude des mécanismes de recombinaison, réparation et réplication, de la variabilité génomique et des bases génomiques de la variabilité phénotypique, de la régulation de l'expression, de l’évolution structurale et fonctionnelle des génomes, notamment dans un contexte d’adaptation.
Une des originalités de ce parcours est sa dimension intégrée alliant des approches allant de la molécule d'ADN aux populations.
Une formation à la recherche par la recherche alliant conférences, atelier pratique et analyses des données
In collaboration with the illumina Solution Center Paris
Un atelier ChIP-seq pour concevoir et réaliser une expérience d'immunoprécipitation de chromatine
Recherche
Cette formation a été conçue en relation avec les laboratoires de l’Université Paris-Saclay dont la recherche est centrée sur la génomique, la génétique, l’évolution, l’épigénétique, les domaines en "Omics", l’écologie moléculaire. Ces unités et équipes, reconnues internationalement, développent des recherche de pointe et plusieurs d’entre elles interviendront dans les formations proposées. Le dialogue Recherche-Enseignement à la base de ce parcours, permet de s’assurer de la cohérence de la formation en fonction des développement récents et des besoins de la recherche.
Un atelier BigData pour l'analyse des données de séquençage à haut-débit
Une formation pratique unique en France !
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De la conception d'une expérience de séquençage à l'acquisition des données à haut-débit par un atelier pratique ChIP-seq
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Présentation des dernières technologies de séquençage
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Introduction à la manipulation de données à haut-débits
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Analyse et traitement bioinformatique des données
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Analyses biostatistiques des expériences
Les unités d'enseignement:
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BigData and ChIP-seq Practical Course (100 h / 12 ECTS):
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non-coding RNAs and epigenetics (25 h / 3 ECTS)
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Génomique fonctionnelle (25 h / 3 ECTS)
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Stabilité et évolution des génomes (25 h / 3 ECTS)
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Génome, Phénotype et populations (25 h / 3 ECTS)
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Les UEs optionnelles (50 h / 6 ECTS au choix)
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Le Stage M2 (6 mois / 30 ECTS)
LANGUE D'ENSEIGNEMENT : Anglais
L'équipe pédagogique du Master GenE2
Les responsables du Master GenE2
- Pierre CAPY, IDEEV
- Cécile FAIRHEAD, IDEEV
- Sébastien BLOYER, I2BC
Secrétariat: Nathalie Beauvois
Coordinateur GenE2 à l'UVSQ:
- Frédéric CRÉMAZY
L'équipe pédagogique
- Emmanuelle BAUDRY
- Antoine BRANCA
- Stéphanie BURY-MONET
- Fabrice CONFALONIERI
- Christine DILLMANN
- Pierre GROGNET
- Myriam HARRY
- Judith LEGRAND
- Gaëlle LELANDAIS
- Anne LOPES
- Élodie MARCHADIER
- Benoit MOINDROT
- Sophie NETTER
Les débouchés
et insertion professionnelle
du Master GenE2
La thèse
Après l'obtention du diplôme de Master, les étudiants ont la possibilité de poursuivre en thèse via l'obtention d'un contrat doctoral proposé par une École Doctorale (ED de Paris-Saclay ou extérieure), de postuler à un programme 'PhD Track' en France ou à l'étranger ou via un fiancement propre du laboratoire d'accueil (SIFRE, ANR, ERC, ...)
Débouchés principaux
Recherche fondamentale ou appliquée en secteur académique (Paris-Saclay, ENS, Institut Pasteur, Institut Curie, Institut Jacques Monod, Genopole, ...) ou R&D en secteur privé, en France ou à l’étranger. Ingénieur d'études, ingénieur de recherche, analyste, ...
Domaines de recherche
Bio-informatique, analyse des données, cancérologie, thérapie génique, biotechnologies, écologie, environnement, conseil génétique, enseignement, veille scientifique, communication scientifique, valorisation ...
International track
Welcome to foreign students !
As part of the 'International Track' program of Paris-Saclay University we are happy to welcome foreign students in our training in English.
Scholarships will be awarded for the 2021-2022 academic year.
Université Paris-Saclay aims to promote access for international students to its Master’s programmes.
Based on academic achievements, these scholarships are awarded for 1 or 2 years to students enrolled in a Master’s programme at Université Paris-Saclay.
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Date fin de sélection des candidatures : 7 mai 2021
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Date limite réception des 2 recommandations et clôture de l’appel : 13 mai 2021
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Réunion du jury : 18 juin 2021
UPSaclay Scholarship Procedure 2021-2022 - (pdf 153.73 KB)
Inscription
Les candidatures pour le Master 2 GenE2 se font via le site de l'Université Paris-Saclay.
Les dossiers de candidature doivent être envoyés dans les 2 vagues de candidature suivantes:
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du 01/02/2021 au 19/04/2021 pour les étudiants postulants au Paris-saclay International Master's Scholarship (voir conditions ci-dessus)
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du 07/05/2021 au 14/07/2021 pour les autres
Le campus Paris Saclay
L'Université Paris-Saclay est l'une des meilleures universités françaises et européennes, à la fois par la qualité de son offre de formation et de son corps enseignant, par la visibilité et la reconnaissance internationale de ses 275 laboratoires de recherche et leurs équipes, ainsi que par l’attention apportée, au quotidien et par tous ses personnels, à l’accueil, l’accompagnement, l’interculturalité et l’épanouissement de ses 65 000 étudiants. L’université Paris-Saclay est constituée de 10 composantes universitaires, de 4 grandes écoles (Agroparistech, CentraleSupélec, Institut d’Optique Graduate School, Ens Paris-Saclay), d’un prestigieux institut de mathématiques (Institut des Hautes Études Scientifiques) et s’appuie sur 6 des pluspuissants organismes de recherche français (CEA, CNRS, Inra, Inria, Inserm et Onera). Elle est associée à deux universités (Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et Université d’Évry Val-d’Essonne) qui fusionneront dans les années à venir et dont les campus jouxtent le territoire du plateau de Saclay et de sa vallée. Ses étudiants, ses enseignants-chercheurs, ses personnels administratifs et techniques et ses partenaires évoluent dans un environnement privilégié, à quelques kilomètres de Paris, où se développent toutes les sciences, les technologies les plus en pointe, l’excellence académique, l’agriculture, le patrimoine historique et un dynamique tissu économique. Ainsi l’Université Paris-Saclay est un établissement de premier plan implanté sur un vaste territoire où il fait bon étudier, vivre et travailler.
